Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setbp1Q9Z180 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Setbp1Q9Z180 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Setbp1Q9Z180 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms