Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sumo3Q9Z172 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sumo3Q9Z172 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms