Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carm1Q9WVG6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Carm1Q9WVG6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms