Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lemd3Q9WU40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lemd3Q9WU40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lemd3Q9WU40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms