Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ggps1Q9WTN0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ggps1Q9WTN0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms