Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nubp1Q9R060 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp1Q9R060 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms