Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc4Q9QZD4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc4Q9QZD4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms