Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VapbQ9QY76 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms