Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cbx8Q9QXV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms