Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms