Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms