Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms