Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr4Q9QUK6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms