Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdkl2Q9QUK0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms