Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc4apQ9JLV2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms