Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cabp1Q9JLK7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp1Q9JLK7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms