Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TefQ9JLC6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TefQ9JLC6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefQ9JLC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms