Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arl6ip1Q9JKW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arl6ip1Q9JKW0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms