Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Uchl3Q9JKB1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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