Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oxct2aQ9JJN4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oxct2aQ9JJN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms