Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip1Q9JJ57 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip1Q9JJ57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms