Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl11Q9JHH5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl11Q9JHH5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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