Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Brd4Q9ESU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brd4Q9ESU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms