Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfip11Q9ERA6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms