Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sall1Q9ER74 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sall1Q9ER74 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms