Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tysnd1Q9DBA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tysnd1Q9DBA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms