Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2e2Q9D902 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e2Q9D902 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms