Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl40Q9D783 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl40Q9D783 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms