Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms