Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D4W2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms