Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms