Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snapc3Q9D2C9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms