Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Xrcc3Q9CXE6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc3Q9CXE6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xrcc3Q9CXE6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xrcc3Q9CXE6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Xrcc3Q9CXE6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xrcc3Q9CXE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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