Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms