Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pin4Q9CWW6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms