Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sycp2Q9CUU3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sycp2Q9CUU3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms