Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ergic3Q9CQE7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms