Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700129C05RikQ9CQ77 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700129C05RikQ9CQ77 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700129C05RikQ9CQ77 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms