Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efcab2Q9CQ46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efcab2Q9CQ46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms