Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rrbp1Q99PL5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms