Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms