Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcgf6Q99NA9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms