Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms