Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf17Q99MV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf17Q99MV7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms