Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms