Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms