Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RtcbQ99LF4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms