Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab28Q99KL7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms