Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms