Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms